蛋白定量
1、蛋白濃度測定
蛋白定量的方法有很多種,應用較多的主要有兩種:BCA蛋白定量檢測法和Bradford蛋白定量檢測法,市售的蛋白定量試劑盒也多基于上述兩種檢測方法而開發的。兩種方法均需配制蛋白標準品,蛋白與定量試劑經過一定時間的反應(BCA法反應為37℃、20-30min,Bradford法反應一般為37℃,5min),酶標儀讀取樣品的OD值,繪制的蛋白標準曲線,依據標準曲線計算WB蛋白的濃度。兩種檢測方法筆者均有使用經驗,相比BCA法,Bradford法不僅節省反應時間,也無需配置反應試劑,簡單、快速、好用,筆者推薦Bradford法測定蛋白濃度。
嚴格來說,每次的蛋白濃度測定均需配制新鮮蛋白標準品,保證每次測到的蛋白濃度的準確性。然而,WB法評估蛋白表達水平本身就是一種半定量或者相對定量,因此在實際蛋白樣本準本及濃度測定時只需保證均一性即可,即使用同樣的標準曲線計算同一批蛋白的濃度,如果計算準備即可保證蛋白上樣時內參水平基本一致。因此,在實際操作中我們只需測定一次標準品的OD值、繪制標準曲線,即可用此曲線來計算后續實驗蛋白的濃度,節省時間和試劑。
2、蛋白濃度的調平
有研究者喜歡計算添加loading buffer及變性以后的蛋白終濃度和上樣體積,然后在蛋白上樣時用loading buffer配平,保證上樣體積基本一致。而筆者更喜歡用loading buffer和蛋白裂解液調整蛋白濃度到基本一致(一般為1-2ug/ul)以后再變性,如此蛋白上樣時只需使用相同體積的蛋白樣品即可,筆者經驗是這樣的方法相對省時且不容易出錯。
蛋白提取
1、蛋白裂解液與裂解環境
現如今,商業化的蛋白裂解有很多中,有強效的、裂解時間短(約5-10min);也有普通的、裂解時間尚可(約30min);也有強效的,裂解時間極短(小于5min)。其中,上述裂解液的裂解環境,一般推薦為冰上或者4℃裂解,減少蛋白降解;而在蛋白裂解液中也推薦加用磷酸酶抑制劑和蛋白酶抑制劑,抑制細胞內酶對蛋白的自然降解。
對于普通蛋白的提取,如實驗時間無特殊,選用普通的蛋白裂解液、冰上裂解即可;對于極易受環境影響的蛋白(比如低氧相關蛋白,HIF-1等),研究報道將細胞從低氧培養箱中取出2-3min即可影響HIF-1表達,因此宜選用強效蛋白裂解液,并在低氧培養箱(37℃)中快速裂解。
2、組織蛋白提取
在組織蛋白提取過程中,一般推薦加用蛋白裂解液(磷酸酶和蛋白酶抑制劑)后,冰上研磨、勻漿化處理組織。組織來源不同,蛋白的產出亦不相同。歡迎各位留言,分享經驗,比如1mg組織能產出多少蛋白。